Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF3

Me3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me3Q8BMF3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Me3Q8BMF3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Me3Q8BMF3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Me3Q8BMF3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Me3Q8BMF3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Me3Q8BMF3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Me3Q8BMF3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Me3Q8BMF3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Me3Q8BMF3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Me3Q8BMF3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Me3Q8BMF3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Me3Q8BMF3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Me3Q8BMF3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Me3Q8BMF3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Me3Q8BMF3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Me3Q8BMF3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Me3Q8BMF3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Me3Q8BMF3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Me3Q8BMF3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Me3Q8BMF3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Me3Q8BMF3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Me3Q8BMF3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Me3Q8BMF3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Me3Q8BMF3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Me3Q8BMF3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Me3Q8BMF3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Me3Q8BMF3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Me3Q8BMF3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Me3Q8BMF3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Me3Q8BMF3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms