Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLQ7

Slc7a4, Cationic amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a4Q8BLQ7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc7a4Q8BLQ7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc7a4Q8BLQ7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc7a4Q8BLQ7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc7a4Q8BLQ7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms