Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tspan12Q8BKT6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan12Q8BKT6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms