Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcal1Q8BJL0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Smarcal1Q8BJL0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarcal1Q8BJL0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms