Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmco3Q8BH01 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmco3Q8BH01 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmco3Q8BH01 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmco3Q8BH01 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmco3Q8BH01 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmco3Q8BH01 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmco3Q8BH01 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmco3Q8BH01 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmco3Q8BH01 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmco3Q8BH01 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmco3Q8BH01 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmco3Q8BH01 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmco3Q8BH01 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmco3Q8BH01 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmco3Q8BH01 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmco3Q8BH01 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmco3Q8BH01 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmco3Q8BH01 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmco3Q8BH01 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmco3Q8BH01 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmco3Q8BH01 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmco3Q8BH01 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmco3Q8BH01 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmco3Q8BH01 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmco3Q8BH01 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmco3Q8BH01 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmco3Q8BH01 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmco3Q8BH01 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmco3Q8BH01 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmco3Q8BH01 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmco3Q8BH01 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmco3Q8BH01 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmco3Q8BH01 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms