Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Htatsf1Q8BGC0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Htatsf1Q8BGC0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Htatsf1Q8BGC0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Htatsf1Q8BGC0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Htatsf1Q8BGC0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Htatsf1Q8BGC0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Htatsf1Q8BGC0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Htatsf1Q8BGC0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Htatsf1Q8BGC0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Htatsf1Q8BGC0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Htatsf1Q8BGC0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Htatsf1Q8BGC0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Htatsf1Q8BGC0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Htatsf1Q8BGC0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Htatsf1Q8BGC0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Htatsf1Q8BGC0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Htatsf1Q8BGC0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Htatsf1Q8BGC0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Htatsf1Q8BGC0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Htatsf1Q8BGC0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Htatsf1Q8BGC0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Htatsf1Q8BGC0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Htatsf1Q8BGC0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Htatsf1Q8BGC0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Htatsf1Q8BGC0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Htatsf1Q8BGC0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Htatsf1Q8BGC0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Htatsf1Q8BGC0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Htatsf1Q8BGC0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms