Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
TnnQ80Z71 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TnnQ80Z71 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TnnQ80Z71 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TnnQ80Z71 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TnnQ80Z71 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TnnQ80Z71 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TnnQ80Z71 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TnnQ80Z71 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
TnnQ80Z71 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TnnQ80Z71 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TnnQ80Z71 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TnnQ80Z71 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TnnQ80Z71 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
TnnQ80Z71 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
TnnQ80Z71 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
TnnQ80Z71 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TnnQ80Z71 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
TnnQ80Z71 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
TnnQ80Z71 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TnnQ80Z71 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TnnQ80Z71 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
TnnQ80Z71 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
TnnQ80Z71 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TnnQ80Z71 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TnnQ80Z71 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
TnnQ80Z71 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
TnnQ80Z71 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TnnQ80Z71 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TnnQ80Z71 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TnnQ80Z71 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TnnQ80Z71 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TnnQ80Z71 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TnnQ80Z71 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TnnQ80Z71 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TnnQ80Z71 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TnnQ80Z71 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TnnQ80Z71 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TnnQ80Z71 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TnnQ80Z71 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TnnQ80Z71 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TnnQ80Z71 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TnnQ80Z71 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TnnQ80Z71 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TnnQ80Z71 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TnnQ80Z71 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TnnQ80Z71 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TnnQ80Z71 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
TnnQ80Z71 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TnnQ80Z71 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TnnQ80Z71 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TnnQ80Z71 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TnnQ80Z71 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TnnQ80Z71 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TnnQ80Z71 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
TnnQ80Z71 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TnnQ80Z71 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TnnQ80Z71 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
TnnQ80Z71 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TnnQ80Z71 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TnnQ80Z71 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TnnQ80Z71 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TnnQ80Z71 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TnnQ80Z71 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TnnQ80Z71 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TnnQ80Z71 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TnnQ80Z71 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TnnQ80Z71 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms