Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg2bQ80XK6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg2bQ80XK6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg2bQ80XK6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg2bQ80XK6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg2bQ80XK6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg2bQ80XK6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg2bQ80XK6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg2bQ80XK6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg2bQ80XK6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg2bQ80XK6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg2bQ80XK6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg2bQ80XK6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg2bQ80XK6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms