Protein–RNA interactions for Protein: Q80WR1

Tspan18, Tetraspanin-18, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan18Q80WR1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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Tspan18Q80WR1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tspan18Q80WR1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tspan18Q80WR1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tspan18Q80WR1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
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Tspan18Q80WR1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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Tspan18Q80WR1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
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Tspan18Q80WR1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
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Tspan18Q80WR1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
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Tspan18Q80WR1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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Tspan18Q80WR1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan18Q80WR1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan18Q80WR1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan18Q80WR1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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Tspan18Q80WR1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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Tspan18Q80WR1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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Tspan18Q80WR1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
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Tspan18Q80WR1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tspan18Q80WR1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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Tspan18Q80WR1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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Tspan18Q80WR1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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Tspan18Q80WR1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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Tspan18Q80WR1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tspan18Q80WR1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tspan18Q80WR1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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Tspan18Q80WR1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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Tspan18Q80WR1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan18Q80WR1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan18Q80WR1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan18Q80WR1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan18Q80WR1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan18Q80WR1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan18Q80WR1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan18Q80WR1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan18Q80WR1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan18Q80WR1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan18Q80WR1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan18Q80WR1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan18Q80WR1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan18Q80WR1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan18Q80WR1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan18Q80WR1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan18Q80WR1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tspan18Q80WR1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms