Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ube3cQ80U95 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ube3cQ80U95 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ube3cQ80U95 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms