Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube2q1Q7TSS2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube2q1Q7TSS2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube2q1Q7TSS2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube2q1Q7TSS2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube2q1Q7TSS2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube2q1Q7TSS2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube2q1Q7TSS2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube2q1Q7TSS2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube2q1Q7TSS2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube2q1Q7TSS2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube2q1Q7TSS2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube2q1Q7TSS2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube2q1Q7TSS2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube2q1Q7TSS2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube2q1Q7TSS2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube2q1Q7TSS2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube2q1Q7TSS2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube2q1Q7TSS2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube2q1Q7TSS2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube2q1Q7TSS2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube2q1Q7TSS2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube2q1Q7TSS2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube2q1Q7TSS2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ube2q1Q7TSS2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
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