Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccp110Q7TSH4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccp110Q7TSH4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms