Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPG0

1700010I14Rik, GI:13385330, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700010I14RikQ7TPG0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
1700010I14RikQ7TPG0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700010I14RikQ7TPG0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700010I14RikQ7TPG0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700010I14RikQ7TPG0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700010I14RikQ7TPG0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700010I14RikQ7TPG0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700010I14RikQ7TPG0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700010I14RikQ7TPG0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700010I14RikQ7TPG0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700010I14RikQ7TPG0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700010I14RikQ7TPG0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700010I14RikQ7TPG0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700010I14RikQ7TPG0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700010I14RikQ7TPG0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700010I14RikQ7TPG0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700010I14RikQ7TPG0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
1700010I14RikQ7TPG0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
1700010I14RikQ7TPG0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
1700010I14RikQ7TPG0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
1700010I14RikQ7TPG0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
1700010I14RikQ7TPG0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
1700010I14RikQ7TPG0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
1700010I14RikQ7TPG0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
1700010I14RikQ7TPG0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
1700010I14RikQ7TPG0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
1700010I14RikQ7TPG0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
1700010I14RikQ7TPG0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
1700010I14RikQ7TPG0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
1700010I14RikQ7TPG0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
1700010I14RikQ7TPG0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
1700010I14RikQ7TPG0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
1700010I14RikQ7TPG0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
1700010I14RikQ7TPG0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
1700010I14RikQ7TPG0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
1700010I14RikQ7TPG0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
1700010I14RikQ7TPG0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
1700010I14RikQ7TPG0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
1700010I14RikQ7TPG0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
1700010I14RikQ7TPG0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
1700010I14RikQ7TPG0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
1700010I14RikQ7TPG0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25■■□□□ 1.59
1700010I14RikQ7TPG0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
1700010I14RikQ7TPG0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
1700010I14RikQ7TPG0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
1700010I14RikQ7TPG0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
1700010I14RikQ7TPG0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
1700010I14RikQ7TPG0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms