Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HhipQ7TN16 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HhipQ7TN16 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HhipQ7TN16 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms