Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sned1Q70E20 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sned1Q70E20 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sned1Q70E20 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sned1Q70E20 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sned1Q70E20 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sned1Q70E20 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Sned1Q70E20 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sned1Q70E20 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sned1Q70E20 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sned1Q70E20 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sned1Q70E20 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sned1Q70E20 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Sned1Q70E20 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sned1Q70E20 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sned1Q70E20 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sned1Q70E20 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sned1Q70E20 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sned1Q70E20 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Sned1Q70E20 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sned1Q70E20 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sned1Q70E20 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sned1Q70E20 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sned1Q70E20 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms