Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ncapd3Q6ZQK0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ncapd3Q6ZQK0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ncapd3Q6ZQK0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ncapd3Q6ZQK0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ncapd3Q6ZQK0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ncapd3Q6ZQK0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ncapd3Q6ZQK0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
Ncapd3Q6ZQK0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
Ncapd3Q6ZQK0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ncapd3Q6ZQK0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ncapd3Q6ZQK0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ncapd3Q6ZQK0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ncapd3Q6ZQK0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ncapd3Q6ZQK0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ncapd3Q6ZQK0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Ncapd3Q6ZQK0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ncapd3Q6ZQK0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Ncapd3Q6ZQK0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Ncapd3Q6ZQK0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ncapd3Q6ZQK0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ncapd3Q6ZQK0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ncapd3Q6ZQK0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ncapd3Q6ZQK0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ncapd3Q6ZQK0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ncapd3Q6ZQK0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ncapd3Q6ZQK0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ncapd3Q6ZQK0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ncapd3Q6ZQK0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ncapd3Q6ZQK0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ncapd3Q6ZQK0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Ncapd3Q6ZQK0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ncapd3Q6ZQK0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ncapd3Q6ZQK0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ncapd3Q6ZQK0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ncapd3Q6ZQK0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ncapd3Q6ZQK0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ncapd3Q6ZQK0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ncapd3Q6ZQK0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ncapd3Q6ZQK0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ncapd3Q6ZQK0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ncapd3Q6ZQK0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ncapd3Q6ZQK0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ncapd3Q6ZQK0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ncapd3Q6ZQK0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Ncapd3Q6ZQK0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ncapd3Q6ZQK0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ncapd3Q6ZQK0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ncapd3Q6ZQK0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ncapd3Q6ZQK0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ncapd3Q6ZQK0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ncapd3Q6ZQK0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ncapd3Q6ZQK0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ncapd3Q6ZQK0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ncapd3Q6ZQK0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ncapd3Q6ZQK0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Ncapd3Q6ZQK0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Ncapd3Q6ZQK0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Ncapd3Q6ZQK0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Ncapd3Q6ZQK0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Ncapd3Q6ZQK0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ncapd3Q6ZQK0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ncapd3Q6ZQK0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ncapd3Q6ZQK0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ncapd3Q6ZQK0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ncapd3Q6ZQK0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Ncapd3Q6ZQK0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Ncapd3Q6ZQK0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ncapd3Q6ZQK0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ncapd3Q6ZQK0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ncapd3Q6ZQK0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ncapd3Q6ZQK0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ncapd3Q6ZQK0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ncapd3Q6ZQK0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ncapd3Q6ZQK0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ncapd3Q6ZQK0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ncapd3Q6ZQK0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ncapd3Q6ZQK0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ncapd3Q6ZQK0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ncapd3Q6ZQK0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ncapd3Q6ZQK0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ncapd3Q6ZQK0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ncapd3Q6ZQK0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ncapd3Q6ZQK0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Ncapd3Q6ZQK0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ncapd3Q6ZQK0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Ncapd3Q6ZQK0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Ncapd3Q6ZQK0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms