Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Opn5Q6VZZ7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Opn5Q6VZZ7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Opn5Q6VZZ7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Opn5Q6VZZ7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Opn5Q6VZZ7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Opn5Q6VZZ7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Opn5Q6VZZ7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn5Q6VZZ7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms