Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf3Q6QR59 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
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Tcaf3Q6QR59 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcaf3Q6QR59 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tcaf3Q6QR59 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
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Tcaf3Q6QR59 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcaf3Q6QR59 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcaf3Q6QR59 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcaf3Q6QR59 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tcaf3Q6QR59 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
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Tcaf3Q6QR59 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
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Tcaf3Q6QR59 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tcaf3Q6QR59 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcaf3Q6QR59 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcaf3Q6QR59 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcaf3Q6QR59 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcaf3Q6QR59 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcaf3Q6QR59 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcaf3Q6QR59 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
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Tcaf3Q6QR59 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcaf3Q6QR59 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcaf3Q6QR59 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcaf3Q6QR59 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcaf3Q6QR59 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcaf3Q6QR59 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcaf3Q6QR59 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcaf3Q6QR59 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcaf3Q6QR59 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcaf3Q6QR59 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tcaf3Q6QR59 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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Tcaf3Q6QR59 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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Tcaf3Q6QR59 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcaf3Q6QR59 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcaf3Q6QR59 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcaf3Q6QR59 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcaf3Q6QR59 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
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Tcaf3Q6QR59 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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Tcaf3Q6QR59 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
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