Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rad54bQ6PFE3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rad54bQ6PFE3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rad54bQ6PFE3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rad54bQ6PFE3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rad54bQ6PFE3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rad54bQ6PFE3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rad54bQ6PFE3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rad54bQ6PFE3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad54bQ6PFE3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad54bQ6PFE3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad54bQ6PFE3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms