Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtifQ6PEE2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CtifQ6PEE2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtifQ6PEE2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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