Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfrlQ6PE55 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PdgfrlQ6PE55 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdgfrlQ6PE55 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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