Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chd4Q6PDQ2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chd4Q6PDQ2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chd4Q6PDQ2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Chd4Q6PDQ2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chd4Q6PDQ2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chd4Q6PDQ2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chd4Q6PDQ2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chd4Q6PDQ2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chd4Q6PDQ2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chd4Q6PDQ2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chd4Q6PDQ2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chd4Q6PDQ2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chd4Q6PDQ2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chd4Q6PDQ2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chd4Q6PDQ2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chd4Q6PDQ2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chd4Q6PDQ2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chd4Q6PDQ2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chd4Q6PDQ2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chd4Q6PDQ2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Chd4Q6PDQ2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Chd4Q6PDQ2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms