Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Gapvd1Q6PAR5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Gapvd1Q6PAR5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Gapvd1Q6PAR5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Gapvd1Q6PAR5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Gapvd1Q6PAR5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Gapvd1Q6PAR5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Gapvd1Q6PAR5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Gapvd1Q6PAR5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Gapvd1Q6PAR5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Gapvd1Q6PAR5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Gapvd1Q6PAR5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Gapvd1Q6PAR5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Gapvd1Q6PAR5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Gapvd1Q6PAR5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Gapvd1Q6PAR5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Gapvd1Q6PAR5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Gapvd1Q6PAR5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Gapvd1Q6PAR5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Gapvd1Q6PAR5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Gapvd1Q6PAR5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Gapvd1Q6PAR5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Gapvd1Q6PAR5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Gapvd1Q6PAR5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Gapvd1Q6PAR5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Gapvd1Q6PAR5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Gapvd1Q6PAR5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
Gapvd1Q6PAR5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Gapvd1Q6PAR5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Gapvd1Q6PAR5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Gapvd1Q6PAR5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Gapvd1Q6PAR5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Gapvd1Q6PAR5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Gapvd1Q6PAR5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Gapvd1Q6PAR5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Gapvd1Q6PAR5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Gapvd1Q6PAR5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Gapvd1Q6PAR5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Gapvd1Q6PAR5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Gapvd1Q6PAR5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Gapvd1Q6PAR5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Gapvd1Q6PAR5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Gapvd1Q6PAR5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Gapvd1Q6PAR5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Gapvd1Q6PAR5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Gapvd1Q6PAR5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Gapvd1Q6PAR5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Gapvd1Q6PAR5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Gapvd1Q6PAR5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Gapvd1Q6PAR5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Gapvd1Q6PAR5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Gapvd1Q6PAR5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Gapvd1Q6PAR5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Gapvd1Q6PAR5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Gapvd1Q6PAR5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Gapvd1Q6PAR5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Gapvd1Q6PAR5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Gapvd1Q6PAR5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Gapvd1Q6PAR5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Gapvd1Q6PAR5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Gapvd1Q6PAR5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Gapvd1Q6PAR5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Gapvd1Q6PAR5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Gapvd1Q6PAR5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Gapvd1Q6PAR5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Gapvd1Q6PAR5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Gapvd1Q6PAR5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Gapvd1Q6PAR5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Gapvd1Q6PAR5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Gapvd1Q6PAR5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Gapvd1Q6PAR5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Gapvd1Q6PAR5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Gapvd1Q6PAR5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Gapvd1Q6PAR5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Gapvd1Q6PAR5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Gapvd1Q6PAR5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Gapvd1Q6PAR5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Gapvd1Q6PAR5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Gapvd1Q6PAR5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Gapvd1Q6PAR5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Gapvd1Q6PAR5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Gapvd1Q6PAR5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Gapvd1Q6PAR5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Gapvd1Q6PAR5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Gapvd1Q6PAR5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Gapvd1Q6PAR5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Gapvd1Q6PAR5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Gapvd1Q6PAR5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Gapvd1Q6PAR5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Gapvd1Q6PAR5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Gapvd1Q6PAR5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Gapvd1Q6PAR5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Gapvd1Q6PAR5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Gapvd1Q6PAR5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Gapvd1Q6PAR5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Gapvd1Q6PAR5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Gapvd1Q6PAR5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Gapvd1Q6PAR5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Gapvd1Q6PAR5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms