Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ1

Bcr, Breakpoint cluster region protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcrQ6PAJ1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BcrQ6PAJ1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BcrQ6PAJ1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BcrQ6PAJ1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms