Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg2aQ6P4T0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atg2aQ6P4T0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg2aQ6P4T0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms