Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A4

Vsig8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig8Q6P3A4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vsig8Q6P3A4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsig8Q6P3A4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms