Protein–RNA interactions for Protein: Q6P069

Sri, Sorcin, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SriQ6P069 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SriQ6P069 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SriQ6P069 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SriQ6P069 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SriQ6P069 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SriQ6P069 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SriQ6P069 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SriQ6P069 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1157.1 ms