Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rprd2Q6NXI6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rprd2Q6NXI6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rprd2Q6NXI6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rprd2Q6NXI6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rprd2Q6NXI6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rprd2Q6NXI6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rprd2Q6NXI6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rprd2Q6NXI6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rprd2Q6NXI6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rprd2Q6NXI6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rprd2Q6NXI6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rprd2Q6NXI6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rprd2Q6NXI6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rprd2Q6NXI6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rprd2Q6NXI6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rprd2Q6NXI6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rprd2Q6NXI6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rprd2Q6NXI6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rprd2Q6NXI6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Rprd2Q6NXI6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rprd2Q6NXI6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rprd2Q6NXI6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rprd2Q6NXI6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rprd2Q6NXI6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rprd2Q6NXI6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rprd2Q6NXI6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rprd2Q6NXI6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rprd2Q6NXI6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rprd2Q6NXI6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rprd2Q6NXI6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rprd2Q6NXI6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rprd2Q6NXI6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rprd2Q6NXI6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rprd2Q6NXI6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rprd2Q6NXI6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rprd2Q6NXI6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rprd2Q6NXI6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rprd2Q6NXI6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rprd2Q6NXI6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rprd2Q6NXI6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rprd2Q6NXI6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Rprd2Q6NXI6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rprd2Q6NXI6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rprd2Q6NXI6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rprd2Q6NXI6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Rprd2Q6NXI6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rprd2Q6NXI6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rprd2Q6NXI6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rprd2Q6NXI6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rprd2Q6NXI6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rprd2Q6NXI6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rprd2Q6NXI6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Rprd2Q6NXI6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rprd2Q6NXI6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rprd2Q6NXI6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Rprd2Q6NXI6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Rprd2Q6NXI6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rprd2Q6NXI6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rprd2Q6NXI6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Rprd2Q6NXI6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rprd2Q6NXI6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rprd2Q6NXI6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rprd2Q6NXI6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rprd2Q6NXI6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rprd2Q6NXI6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms