Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fndc3bQ6NWW9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fndc3bQ6NWW9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fndc3bQ6NWW9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms