Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Colgalt2Q6NVG7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Colgalt2Q6NVG7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms