Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ7

Ltv1, Protein LTV1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltv1Q6NSQ7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ltv1Q6NSQ7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ltv1Q6NSQ7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ltv1Q6NSQ7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms