Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt40Q6IFX3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Krt40Q6IFX3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
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