Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nckap5lQ6GQX2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nckap5lQ6GQX2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nckap5lQ6GQX2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nckap5lQ6GQX2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nckap5lQ6GQX2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nckap5lQ6GQX2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nckap5lQ6GQX2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nckap5lQ6GQX2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nckap5lQ6GQX2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nckap5lQ6GQX2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nckap5lQ6GQX2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Nckap5lQ6GQX2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Nckap5lQ6GQX2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Nckap5lQ6GQX2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nckap5lQ6GQX2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nckap5lQ6GQX2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nckap5lQ6GQX2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Nckap5lQ6GQX2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nckap5lQ6GQX2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nckap5lQ6GQX2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nckap5lQ6GQX2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nckap5lQ6GQX2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nckap5lQ6GQX2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nckap5lQ6GQX2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Nckap5lQ6GQX2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Nckap5lQ6GQX2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nckap5lQ6GQX2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nckap5lQ6GQX2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nckap5lQ6GQX2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nckap5lQ6GQX2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nckap5lQ6GQX2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nckap5lQ6GQX2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nckap5lQ6GQX2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nckap5lQ6GQX2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nckap5lQ6GQX2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nckap5lQ6GQX2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nckap5lQ6GQX2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nckap5lQ6GQX2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nckap5lQ6GQX2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nckap5lQ6GQX2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nckap5lQ6GQX2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nckap5lQ6GQX2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nckap5lQ6GQX2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nckap5lQ6GQX2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nckap5lQ6GQX2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nckap5lQ6GQX2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Nckap5lQ6GQX2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nckap5lQ6GQX2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nckap5lQ6GQX2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nckap5lQ6GQX2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms