Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cep290Q6A078 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cep290Q6A078 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cep290Q6A078 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.9 ms