Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Thsd7aQ69ZU6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Thsd7aQ69ZU6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Thsd7aQ69ZU6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Thsd7aQ69ZU6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Thsd7aQ69ZU6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Thsd7aQ69ZU6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Thsd7aQ69ZU6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Thsd7aQ69ZU6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Thsd7aQ69ZU6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Thsd7aQ69ZU6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Thsd7aQ69ZU6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Thsd7aQ69ZU6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Thsd7aQ69ZU6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Thsd7aQ69ZU6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Thsd7aQ69ZU6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Thsd7aQ69ZU6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Thsd7aQ69ZU6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms