Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sbno1Q689Z5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sbno1Q689Z5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sbno1Q689Z5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sbno1Q689Z5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Sbno1Q689Z5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sbno1Q689Z5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sbno1Q689Z5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Sbno1Q689Z5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Sbno1Q689Z5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Sbno1Q689Z5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sbno1Q689Z5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sbno1Q689Z5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sbno1Q689Z5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Sbno1Q689Z5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sbno1Q689Z5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sbno1Q689Z5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sbno1Q689Z5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sbno1Q689Z5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sbno1Q689Z5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sbno1Q689Z5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sbno1Q689Z5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sbno1Q689Z5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sbno1Q689Z5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sbno1Q689Z5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sbno1Q689Z5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sbno1Q689Z5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sbno1Q689Z5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sbno1Q689Z5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sbno1Q689Z5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sbno1Q689Z5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sbno1Q689Z5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sbno1Q689Z5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sbno1Q689Z5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sbno1Q689Z5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Sbno1Q689Z5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sbno1Q689Z5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sbno1Q689Z5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sbno1Q689Z5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sbno1Q689Z5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sbno1Q689Z5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sbno1Q689Z5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sbno1Q689Z5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sbno1Q689Z5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.8 ms