Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ino80dQ66JY2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ino80dQ66JY2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms