Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprjQ64455 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprjQ64455 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprjQ64455 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprjQ64455 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprjQ64455 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprjQ64455 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprjQ64455 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprjQ64455 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprjQ64455 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprjQ64455 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprjQ64455 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprjQ64455 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprjQ64455 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprjQ64455 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprjQ64455 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprjQ64455 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprjQ64455 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprjQ64455 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprjQ64455 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprjQ64455 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprjQ64455 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprjQ64455 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprjQ64455 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprjQ64455 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprjQ64455 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprjQ64455 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprjQ64455 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprjQ64455 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprjQ64455 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprjQ64455 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PtprjQ64455 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprjQ64455 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprjQ64455 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprjQ64455 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprjQ64455 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprjQ64455 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprjQ64455 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprjQ64455 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprjQ64455 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprjQ64455 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprjQ64455 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprjQ64455 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprjQ64455 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprjQ64455 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprjQ64455 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprjQ64455 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprjQ64455 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprjQ64455 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprjQ64455 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprjQ64455 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprjQ64455 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprjQ64455 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprjQ64455 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprjQ64455 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprjQ64455 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprjQ64455 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprjQ64455 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprjQ64455 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprjQ64455 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprjQ64455 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprjQ64455 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprjQ64455 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms