Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18Q62280 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ss18Q62280 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ss18Q62280 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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