Protein–RNA interactions for Protein: Q62230

Siglec1, Sialoadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siglec1Q62230 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Siglec1Q62230 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Siglec1Q62230 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms