Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sin3bQ62141 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sin3bQ62141 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sin3bQ62141 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms