Protein–RNA interactions for Protein: Q61116

Znf235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf235Q61116 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf235Q61116 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf235Q61116 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 220.2 ms