Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TmpoQ61033 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TmpoQ61033 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TmpoQ61033 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TmpoQ61033 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TmpoQ61033 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TmpoQ61033 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TmpoQ61033 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TmpoQ61033 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TmpoQ61033 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TmpoQ61033 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TmpoQ61033 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TmpoQ61033 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TmpoQ61033 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TmpoQ61033 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TmpoQ61033 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TmpoQ61033 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TmpoQ61033 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TmpoQ61033 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TmpoQ61033 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TmpoQ61033 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TmpoQ61033 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TmpoQ61033 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TmpoQ61033 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TmpoQ61033 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TmpoQ61033 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TmpoQ61033 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TmpoQ61033 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TmpoQ61033 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TmpoQ61033 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms