Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp1r1bQ60829 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp1r1bQ60829 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp1r1bQ60829 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp1r1bQ60829 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp1r1bQ60829 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp1r1bQ60829 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppp1r1bQ60829 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppp1r1bQ60829 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppp1r1bQ60829 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp1r1bQ60829 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp1r1bQ60829 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp1r1bQ60829 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp1r1bQ60829 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp1r1bQ60829 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ppp1r1bQ60829 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppp1r1bQ60829 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppp1r1bQ60829 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms