Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klf4Q60793 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Klf4Q60793 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Klf4Q60793 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Klf4Q60793 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klf4Q60793 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klf4Q60793 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klf4Q60793 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klf4Q60793 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klf4Q60793 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klf4Q60793 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klf4Q60793 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klf4Q60793 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klf4Q60793 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klf4Q60793 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klf4Q60793 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klf4Q60793 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klf4Q60793 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klf4Q60793 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klf4Q60793 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klf4Q60793 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klf4Q60793 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klf4Q60793 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klf4Q60793 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klf4Q60793 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klf4Q60793 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klf4Q60793 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klf4Q60793 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms