Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SkiQ60698 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SkiQ60698 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SkiQ60698 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SkiQ60698 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SkiQ60698 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SkiQ60698 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SkiQ60698 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SkiQ60698 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SkiQ60698 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SkiQ60698 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SkiQ60698 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SkiQ60698 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SkiQ60698 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SkiQ60698 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms