Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf15Q5UBV8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms