Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Scaf1Q5U4C3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Scaf1Q5U4C3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Scaf1Q5U4C3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Scaf1Q5U4C3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Scaf1Q5U4C3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Scaf1Q5U4C3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Scaf1Q5U4C3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scaf1Q5U4C3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scaf1Q5U4C3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scaf1Q5U4C3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scaf1Q5U4C3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scaf1Q5U4C3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scaf1Q5U4C3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scaf1Q5U4C3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scaf1Q5U4C3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scaf1Q5U4C3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scaf1Q5U4C3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scaf1Q5U4C3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scaf1Q5U4C3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scaf1Q5U4C3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scaf1Q5U4C3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scaf1Q5U4C3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scaf1Q5U4C3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scaf1Q5U4C3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scaf1Q5U4C3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scaf1Q5U4C3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scaf1Q5U4C3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scaf1Q5U4C3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scaf1Q5U4C3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scaf1Q5U4C3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scaf1Q5U4C3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scaf1Q5U4C3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scaf1Q5U4C3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms