Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Mks1Q5SW45 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.6 ms