Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVR0

Tbc1d9b, TBC1 domain family member 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tbc1d9bQ5SVR0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tbc1d9bQ5SVR0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tbc1d9bQ5SVR0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tbc1d9bQ5SVR0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tbc1d9bQ5SVR0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tbc1d9bQ5SVR0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tbc1d9bQ5SVR0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tbc1d9bQ5SVR0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tbc1d9bQ5SVR0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tbc1d9bQ5SVR0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tbc1d9bQ5SVR0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tbc1d9bQ5SVR0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tbc1d9bQ5SVR0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tbc1d9bQ5SVR0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tbc1d9bQ5SVR0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tbc1d9bQ5SVR0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tbc1d9bQ5SVR0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tbc1d9bQ5SVR0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tbc1d9bQ5SVR0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tbc1d9bQ5SVR0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tbc1d9bQ5SVR0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tbc1d9bQ5SVR0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tbc1d9bQ5SVR0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tbc1d9bQ5SVR0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tbc1d9bQ5SVR0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tbc1d9bQ5SVR0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tbc1d9bQ5SVR0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.2 ms